Le professeur Jean Marc Ayoubi effectue sa scolarité et ses études de médecine à Toulouse. Il est diplômé en Chirurgie générale et en gynécologie-obstétrique en 1994. Il s’est ensuite engagé dans une carrière hospitalouniversitaire avec un DEA d’Analyse de systèmes de Santé et une thèse ès-sciences en 2002 sur l'apport des nouvelles technologies en Gynécologie - obstétrique et reproduction. Il est ensuite nommé professeur des universités – praticien hospitalier, au CHU de Toulouse puis au CHU de Paris. Depuis 2007, il est Chef de Service de GynécologieObstétrique de l’hôpital FOCH, et Directeur de l’école de Sages-Femmes où il est à l’origine de la création du département de prise en charge de l’infertilité.